Syncovery は、当サイトから最新バージョンをインストールすることで、更新またはアップグレードできます。古いバージョンはアンインストールする必要はありません。新しいバージョンを古いバージョンの上にそのままインストールできます。
プログラム内の「ヘルプ→更新の確認」を使って、新しいバージョンがあるかどうかを確認することもできます。
Super Flexible File Synchronizer からアップグレードする場合も、同様に新しいバージョンをインストールするだけです。すると、前の製品からプロファイルと設定を移行するかどうかを自動的に尋ねられます。この質問が表示されない場合は、Syncovery 内の「ファイル」メニューから「V5 からの移行…」を選択できます（高度なモード）。
Syncovery バージョン 6 では、以前のバージョンとは異なる登録コードを使用します。アップグレード版を入手するには、http://syncovery.com/upgrade/ にアクセスしてください。
場合によっては、Windows インストーラーが再起動を要求することがあります。再起動を避ける必要がある場合は、更新をインストールする前にアプリケーションを終了し、すべてのジョブを停止してスケジューラを停止してください。トレイアイコンを右クリックして「終了」を選択します。タスク マネージャーを使って、Syncovery、SuperFlexible、ExtremeSync のプロセスが実行されていないことを確認してください。